Des chercheurs du Genoscope
(Institut Génomique/CEA/CNRS) et de l’Institut Pasteur
ont re-séquencé le génome de
Bacillus subtilis avec l’une des
dernières technologies de séquençage, le
pyroséquencage, et prédit, de novo, la fonction des
gènes en utilisant la plateforme d’annotation
«MicroScope» (Interface graphique MaGe).
Le génome de cette bactérie modèle avait
été séquencé une première fois
en 1997 par un consortium composé de 30 laboratoires. Mais
ces premiers travaux présentaient des expertises de
qualités inégales qui ralentissaient
l’avancée de nombreux domaines inférant
à ce modèle, comme la phylogénie, la
génétique bactérienne, l’étude
des bactéries pathogènes (staphylocoques,
streptocoques) et la recherche de biocatalyseurs pour
l’industrie (amylase pour le pain, protéases pour les
détergents, etc.). Une validation expérimentale de la
fonction des gènes, prédite par comparaison de
séquences, devrait, par la suite, confirmer les annotations
expertes/manuelles du génome de B. subtilis.
Contact : Claudine
Médigue, chef de laboratoire de génomique comparative
(UMR8030) - 01 60 87 84 59.